洞口县卫生防疫站始建于一九五六年，属全民事业单位，行政上隶属于洞口县卫生局，是全县疾病预防控制、卫生监督检测、预防技术咨询与服务、基层防疫人员培训和卫生健康教育的业务技术指导中心。下设流行病防治、计划免疫、消杀灭、地慢病防治、结核病防治、性病防治、寄生虫病防治、食品卫生、环境卫生、劳动卫生、放射卫生、学校卫生、健康教育、卫生检验、预防医学门诊部十五个业务科室和站长室、办公室、财务后勤三个行政科室。

洞口县卫生防疫站现有在职职工57人，医技人员40人，其中主管医师15人，主管技师2人，医技师21人，医技士4人，拥有300毫安X光机、冷原子荧光测汞仪、原子吸收光谱仪、气相色谱仪、酶标仪、B超机、心电图等各种检测设备80余台。该站始终坚持“预防为主”工作方针，开展对全县食品、环境、水质、空气、土壤、化妆品、工业尘毒的监测，青少年体质与健康监护，传染病防治及人群免疫水平的监测，地慢病、结核病、性病查治、健康教育、科研培训以及救灾防病和突发公共卫生事件应急处理等卫生防疫业务。

40多年来，通过历代卫生防疫人员的艰苦奋斗和不懈努力，洞口县的卫生防疫工作取得了辉煌的成绩，各类传染病发病率得到了有效地控制，全县卫生质量整体水平有了明显改善，人民群众健康水平得到了大幅度提高。特别是在今年全民抗击“非典”的战役中，县防疫站充分发挥主力军作用，恪尽职守，努力做到了十个到位，确保了“非典”防治措施的全面落实，为及时发现并成功处置一例输入性“非典”疫情、防止二代病例的发生、最终打赢抗击“非典”这场硬仗奠定了坚实的基础，受到了卫生部督查组的高度评价，为洞口县、邵阳市乃至湖南省的防治“非典”工作立了功、争了光。

洞口县卫生防疫站曾获得两项科技推广奖及科技成果奖，并被卫生部和省卫生厅授予卫生文明建设先进单位，先后获国家级奖励3次，省级奖励27次。一九九八年度被中华人民共和国卫生部授予县级一等卫生防疫站，连续五年被评为市、县卫生防疫工作先进单位。